Спецслужбы вычислили организатора взрыва в метро по телефонным звонкам. Изучив звонки Акбаржона Джалилова, который совершил самоподрыв в петербургском метро, спецслужбы вышли на Аброра Азимова. Как оказалось, Джалилов позвонил Азимову перед самым взрывом. Также отмечается, что Азимов был единственным, с кем Джалилов связывался по телефону. По некоторым данным, в своём последнем звонке террорист сообщил организатору, что готов совершить теракт.
Аброра Азимова задержали в понедельник, 17 апреля. Задержание произошло в Одинцовском районе Подмосковья у железнодорожного перехода. После теракта Азимов скрывался, однако в понедельник он приобрёл пару новых телефонов и сим-карты, по которым его и смогли вычислить. Организатор теракта раскрыл своё местонахождение после того, как активировал одну из сим-карт.
Всё происходящее было снято на видео и опубликовано. При задержании у него нашли пистолет Макарова. На вопрос, догадывается ли он, за что его задержали, Аброр Азимов ответил утвердительно.